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中国科学院昆明植物研究所简称昆明植物所 ，是中国科学院直属科研机构,是我国植物学、植物化学领域重要的综合性研究机构 。
中国科学院昆明植物研究所前身是静生生物调查所和云南省教育厅于1938年7月合作成立的云南农林植物研究所 。1950年4月转属中国科学院 ，更名为中国科学院植物分类研究所昆明工作站。1953年3月更名为中国科学院植物研究所昆明工作站 。
1959年4月，经国家科委批准 ，正式成立中国科学院昆明植物研究所 。研究所将植物分类与生物地理 、植物化学与天然产物研发 、野生种质资源保藏与利用、民族植物学与区域发展 、资源植物研发与产业化这五个方面为重点研究领域。
据2015年10月研究所官网显示 ，该所共有在职职工539人，包括研究员及正高级工程技术人员66人 、副研究员及高级工程技术人员110人；研究系统设置“三室一库 ” ，研究所占地面积5318亩 ，建有昆明和丽江两个园区 。
科研部门
截至2015年5月，该所研究系统设置“三室一库 ”，即1个国家重点实验室、1个中国科学院重点实验室 、1个所级重点实验设施 、1个种质资源库；此外 ，还有1个植物园、2个联合共建中心 。
科研成果
1 、科研任务承担2010-2014年 ，全所对外争取纵向科研项目总经费3.86亿元，其中 ，主持国家重大科学研究计划1项 ，国家科技支撑计划1项，科技基础性工作专项2项 ，重大新药创制专项1项 ，国家杰出青年科学基金2项，国家自然科学基金重点项目（含联合基金）17项。
2 、科研获奖情况：授权各类专利119件；获得省部级及以上各类科技奖励23项 ，先后获云南省自然科学特等奖2项 ，云南省自然科学一等奖2项，云南省科技进步一等奖2项 ，吴征镒获2007年度国家最高科学技术奖 ，周俊、孙汉董、李德铢先后获云南省科学技术杰出贡献奖 。
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