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底肥深施应同土壤耕翻作业相结合 。方法有两种：①先撒肥后耕翻。要尽可能缩短化肥暴露在地表的时间 ，尤其对碳酸氢铵等在空气中易挥发的化肥 ，要做到随撒肥随耕翻，使其深埋入土 。此种施肥方法可在犁前加装撒肥装置，也可使用专用撒肥机 ，肥带宽基本同后边犁耕幅相当 。作业要求：化肥撒施均匀 ，施量符合作物栽培的农艺要求，耕翻后化肥埋入土壤深度大于6厘米 ，地表无可见的颗粒。②边耕翻边施肥。一般可对现有耕翻犁进行改造 ，增加排肥装置，通常将排肥导管安装在犁铧后面 ，随着犁铧翻垡将化肥施于垡面上或犁沟底（根据当地农艺要求的底肥深浅调整） ，然后犁铧翻垡覆盖，达到深施肥的目的 ，因而此法也称为犁沟施肥 。作业要求：施肥深度大于6厘米 ，肥带宽度3～5厘米，排肥均匀连续 ，无明显断条 ，施肥量满足作物栽培的农艺要求 。
农民种大棚，换茬前都需要施用基肥，大棚内施用基肥也是有讲究的。
(1)根据棚室年龄确定施肥种类及数量老棚与新棚基肥施用有区别 。
①老棚
由于常年使用肥料 ，尤其是在每年蔬菜进人结果期后 ，大量冲施化学肥料，土壤养分含量高 ，在给老棚施用基肥时化肥要减量 ，般每亩可施复合肥 50千克左右、 粪肥20立方左右 、 有机肥100于克左右 。另外，还需施人生物菌肥 ，每亩40~60千克 ，用来改良土壤。
②新棚
大量施用有机肥，补充土壤中的有机质 。
一是增加鸡粪等粪肥的施用量
新建棚室多是生土 ，有机质缺乏 ， 因此要大量补充有机肥，如稻壳粪 、鸡粪等有机肥 ，可以将亩用量提高到35立方米左右 。这些有机肥施用后 ，虽然不能迅速增加土壤中的有机质，但是可以在一定程度 上改善土壤的理化性状。
二是增施生物菌肥
新建的大棚，土壤中的各种微生物含量较少 ，即使将大量的鸡粪 ，稍亮粪等有机肥施用到大棚土壤中，也因为土壤中缺乏微生物 ，不能快速地将有机肥分解转化成土壤有机质 ，四此，在新建大棚土壤中旋用稍亮粪 ，鸡粪等有机肥时 ，一定要注意增陈生物菌肥40~70千克，以快速补充土壤中的微生物 。
三是增施商品有机肥
商品有机肥的有机质含量高 。可以在第一次往新建大棚土壤中施用粪肥后 ，结合施用商品有机肥 ，每亩施用500千克左右，保证蔬菜生长前期所需的营养。
首先要注意增施氮、磷 、钾肥 。新建大棚土壤都是生土 ，土壤中的氮 、磷、钾含量极低 ，所以在施用基肥时一定要注意增施氮、磷 、钾肥料 。一般每亩施复合肥50千克左右。
其次，要注重中微量元素的使用。蔬菜要健康生长，不仅需要氮 、磷、钾等大量元素 ，还需要钙 、铁 、硼等10余种中微量元素 。新建大棚土壤中缺乏中微量元素 ，要注意增施钙、镁肥，可每亩施100千克钙镁磷肥或过磷酸钙等 。此外 ，蔬菜的生长还需要铁 、锰 、硼、锌 、铜 、钥、氯等数种微量元素 ，可每亩施用多元素矿物肥50千克左右。
(2)根据土壤的质地合理搭配基肥在棚室生产中，土壤区别较为明显的是沙土地与黏土地 ，前者保水保肥能力差 ，后者保水保肥能力强，沙土地的肥力水平要低于黏土地 。在施用基肥时 ，要区别对待 。沙土地应增设粪肥 ，同时配合施用土壤改良剂，以增强土壤的保水保肥能力。黏土地透气性差 ，团粒结构形成少 ，建议通过施用稻壳鸡粪或秸秆还田等措施加以改良 。
(3)根据种植作物决定施肥量不同的蔬菜种类基肥用量有差异 。豆类蔬菜因其根部共生的根瘤菌具有固氮能力，所以可减少基肥中氮肥的使用量，以免发生徒长。可在每亩施用5~8立方鸡粪的基础上 ，配合5千克全水溶性肥料 。另外 ，豆类蔬菜对硼 、钼等微量元素需求敏感，一 旦缺乏易造成落花落荚 ，故可在基肥中每亩施人硼砂0.5~1.0千克 、钥酸铵0.03~0.20千克；而瓜类、茄果类蔬菜需肥量大 ，鸡粪每亩施用量在20立米米左右，复合肥40~50千克 。
(4)在施用基肥前 ，还要看棚内土壤是否经过土壤处理经过土壤消毒处理的地块 ，其中所含的有益菌数量减少，故需通过增施生物菌肥加以补充 ，以维持土壤微生态平衡 ，预防烂根、死棵发生。而尚未进行土壤消毒处理的地块，存在板结 、透气性差 、土传病菌多等不足 ，建议平衡施肥 ，增施菌肥，深翻土壤，解决土壤恶化等问题 。
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